Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR1AO95602 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
POLR1AO95602 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms