Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SEC24AO95486 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24AO95486 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms