Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAPLNO95428 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms