Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms