Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNAPINO95295 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms