Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms