Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCNKO75909 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCNKO75909 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCNKO75909 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCNKO75909 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCNKO75909 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCNKO75909 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCNKO75909 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCNKO75909 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCNKO75909 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCNKO75909 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCNKO75909 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCNKO75909 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCNKO75909 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCNKO75909 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCNKO75909 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNKO75909 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms