Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LRP6O75581 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRP6O75581 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRP6O75581 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LRP6O75581 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRP6O75581 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRP6O75581 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LRP6O75581 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP6O75581 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP6O75581 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP6O75581 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP6O75581 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP6O75581 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP6O75581 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP6O75581 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP6O75581 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP6O75581 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP6O75581 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP6O75581 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP6O75581 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP6O75581 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP6O75581 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRP6O75581 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRP6O75581 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRP6O75581 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRP6O75581 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRP6O75581 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRP6O75581 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRP6O75581 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRP6O75581 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRP6O75581 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRP6O75581 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRP6O75581 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRP6O75581 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRP6O75581 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRP6O75581 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRP6O75581 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRP6O75581 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRP6O75581 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRP6O75581 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRP6O75581 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRP6O75581 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRP6O75581 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRP6O75581 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRP6O75581 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRP6O75581 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRP6O75581 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRP6O75581 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRP6O75581 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRP6O75581 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LRP6O75581 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRP6O75581 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRP6O75581 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRP6O75581 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LRP6O75581 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LRP6O75581 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRP6O75581 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRP6O75581 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRP6O75581 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRP6O75581 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRP6O75581 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRP6O75581 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LRP6O75581 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRP6O75581 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRP6O75581 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRP6O75581 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LRP6O75581 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LRP6O75581 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LRP6O75581 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LRP6O75581 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRP6O75581 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
LRP6O75581 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRP6O75581 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LRP6O75581 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRP6O75581 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRP6O75581 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRP6O75581 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRP6O75581 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRP6O75581 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRP6O75581 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRP6O75581 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRP6O75581 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LRP6O75581 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRP6O75581 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRP6O75581 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRP6O75581 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRP6O75581 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LRP6O75581 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRP6O75581 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRP6O75581 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LRP6O75581 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LRP6O75581 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRP6O75581 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LRP6O75581 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRP6O75581 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRP6O75581 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRP6O75581 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRP6O75581 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRP6O75581 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRP6O75581 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms