Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC45O75419 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC45O75419 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC45O75419 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC45O75419 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC45O75419 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC45O75419 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC45O75419 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC45O75419 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC45O75419 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC45O75419 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC45O75419 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC45O75419 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC45O75419 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC45O75419 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC45O75419 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC45O75419 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC45O75419 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC45O75419 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC45O75419 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC45O75419 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC45O75419 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC45O75419 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC45O75419 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC45O75419 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC45O75419 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC45O75419 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC45O75419 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC45O75419 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC45O75419 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC45O75419 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC45O75419 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC45O75419 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC45O75419 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC45O75419 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC45O75419 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC45O75419 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC45O75419 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC45O75419 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC45O75419 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC45O75419 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC45O75419 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC45O75419 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC45O75419 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC45O75419 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC45O75419 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC45O75419 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC45O75419 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC45O75419 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC45O75419 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC45O75419 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC45O75419 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC45O75419 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC45O75419 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC45O75419 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC45O75419 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC45O75419 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC45O75419 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC45O75419 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC45O75419 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC45O75419 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC45O75419 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC45O75419 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC45O75419 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC45O75419 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC45O75419 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC45O75419 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC45O75419 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC45O75419 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC45O75419 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC45O75419 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC45O75419 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC45O75419 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC45O75419 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC45O75419 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC45O75419 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC45O75419 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC45O75419 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC45O75419 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC45O75419 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC45O75419 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC45O75419 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC45O75419 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC45O75419 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC45O75419 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC45O75419 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC45O75419 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC45O75419 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC45O75419 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC45O75419 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC45O75419 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC45O75419 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC45O75419 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC45O75419 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC45O75419 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC45O75419 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC45O75419 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC45O75419 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC45O75419 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC45O75419 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms