Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBNO60934 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBNO60934 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBNO60934 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBNO60934 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBNO60934 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NBNO60934 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBNO60934 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBNO60934 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBNO60934 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBNO60934 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBNO60934 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBNO60934 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NBNO60934 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBNO60934 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBNO60934 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBNO60934 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBNO60934 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBNO60934 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBNO60934 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBNO60934 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBNO60934 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBNO60934 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBNO60934 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBNO60934 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBNO60934 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBNO60934 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBNO60934 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBNO60934 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBNO60934 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBNO60934 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBNO60934 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBNO60934 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBNO60934 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBNO60934 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBNO60934 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBNO60934 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBNO60934 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBNO60934 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBNO60934 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBNO60934 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBNO60934 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBNO60934 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBNO60934 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBNO60934 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBNO60934 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NBNO60934 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBNO60934 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBNO60934 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBNO60934 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBNO60934 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBNO60934 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NBNO60934 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBNO60934 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBNO60934 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBNO60934 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBNO60934 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBNO60934 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBNO60934 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBNO60934 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms