Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF5BO60841 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.7 ms