Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
KIAA0556O60303 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms