Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD6O43541 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms