Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms