Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms