Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN4O14817 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms