Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD8O14715 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD8O14715 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms