Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX7O00628 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX7O00628 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX7O00628 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX7O00628 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX7O00628 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX7O00628 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX7O00628 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX7O00628 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX7O00628 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX7O00628 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX7O00628 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX7O00628 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX7O00628 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX7O00628 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX7O00628 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX7O00628 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX7O00628 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX7O00628 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX7O00628 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX7O00628 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX7O00628 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX7O00628 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX7O00628 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX7O00628 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX7O00628 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX7O00628 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX7O00628 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX7O00628 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX7O00628 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX7O00628 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX7O00628 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX7O00628 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX7O00628 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms