Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXLO00592 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXLO00592 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXLO00592 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXLO00592 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXLO00592 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXLO00592 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXLO00592 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXLO00592 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXLO00592 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXLO00592 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXLO00592 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXLO00592 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXLO00592 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXLO00592 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXLO00592 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXLO00592 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXLO00592 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXLO00592 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXLO00592 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXLO00592 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXLO00592 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXLO00592 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXLO00592 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXLO00592 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXLO00592 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXLO00592 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXLO00592 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXLO00592 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXLO00592 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXLO00592 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXLO00592 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXLO00592 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXLO00592 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXLO00592 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXLO00592 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXLO00592 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXLO00592 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXLO00592 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXLO00592 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXLO00592 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXLO00592 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXLO00592 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXLO00592 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXLO00592 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXLO00592 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXLO00592 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXLO00592 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXLO00592 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXLO00592 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXLO00592 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXLO00592 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PODXLO00592 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXLO00592 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXLO00592 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXLO00592 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXLO00592 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXLO00592 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXLO00592 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXLO00592 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXLO00592 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms