Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP1O00294 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP1O00294 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP1O00294 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP1O00294 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP1O00294 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP1O00294 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP1O00294 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP1O00294 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP1O00294 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP1O00294 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP1O00294 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP1O00294 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP1O00294 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP1O00294 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP1O00294 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP1O00294 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP1O00294 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP1O00294 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP1O00294 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP1O00294 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP1O00294 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP1O00294 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP1O00294 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP1O00294 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TULP1O00294 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TULP1O00294 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TULP1O00294 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TULP1O00294 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TULP1O00294 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TULP1O00294 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TULP1O00294 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TULP1O00294 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TULP1O00294 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP1O00294 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP1O00294 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP1O00294 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP1O00294 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP1O00294 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP1O00294 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP1O00294 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP1O00294 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP1O00294 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP1O00294 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP1O00294 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TULP1O00294 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP1O00294 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP1O00294 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP1O00294 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP1O00294 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP1O00294 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TULP1O00294 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms