Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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