Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP17L11C9JVI0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms