Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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