Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf172C9J069 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms