Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BECN2A8MW95 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms