Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEURL1BA8MQ27 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEURL1BA8MQ27 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEURL1BA8MQ27 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEURL1BA8MQ27 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEURL1BA8MQ27 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEURL1BA8MQ27 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEURL1BA8MQ27 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEURL1BA8MQ27 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEURL1BA8MQ27 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEURL1BA8MQ27 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEURL1BA8MQ27 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEURL1BA8MQ27 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEURL1BA8MQ27 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEURL1BA8MQ27 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEURL1BA8MQ27 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEURL1BA8MQ27 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEURL1BA8MQ27 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms