Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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