Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms