Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCHNA4D1U4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms