Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
HMX2A2RU54 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms