Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP16Q9Y5T5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms