Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLDN16Q9Y5I7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN16Q9Y5I7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms