Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AFG3L2Q9Y4W6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms