Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms