Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms