Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.81■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC47.81■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC47.81■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC47.81■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC47.81■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC47.81■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC47.81■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC47.81■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC47.81■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC47.8■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC47.8■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC47.8■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.79■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.79■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC47.79■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC47.78■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC47.78■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC47.78■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.78■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC47.77■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC47.77■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC47.76■■■■■ 5.24
NISCHQ9Y2I1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.75■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.74■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC47.74■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC47.74■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC47.73■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC47.73■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC47.73■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC47.72■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC47.71■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.71■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC47.71■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC47.71■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC47.71■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC47.7■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC47.7■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.7■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC47.7■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC47.7■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC47.69■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.23
NISCHQ9Y2I1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
NISCHQ9Y2I1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.69■■■■■ 5.22
NISCHQ9Y2I1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC47.69■■■■■ 5.22
NISCHQ9Y2I1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
NISCHQ9Y2I1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC47.68■■■■■ 5.22
NISCHQ9Y2I1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
NISCHQ9Y2I1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
NISCHQ9Y2I1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC47.68■■■■■ 5.22
NISCHQ9Y2I1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
NISCHQ9Y2I1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC47.67■■■■■ 5.22
NISCHQ9Y2I1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.67■■■■■ 5.22
NISCHQ9Y2I1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
NISCHQ9Y2I1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
NISCHQ9Y2I1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
NISCHQ9Y2I1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC47.67■■■■■ 5.22
NISCHQ9Y2I1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC47.67■■■■■ 5.22
NISCHQ9Y2I1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
NISCHQ9Y2I1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC47.66■■■■■ 5.22
NISCHQ9Y2I1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC47.66■■■■■ 5.22
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