Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SCML2Q9UQR0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCML2Q9UQR0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms