Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNQ9UQP3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNQ9UQP3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms