Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms