Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms