Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms