Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN2Q9UNF0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN2Q9UNF0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms