Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms