Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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RAB23Q9ULC3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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RAB23Q9ULC3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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RAB23Q9ULC3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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RAB23Q9ULC3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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RAB23Q9ULC3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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RAB23Q9ULC3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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RAB23Q9ULC3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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RAB23Q9ULC3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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RAB23Q9ULC3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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RAB23Q9ULC3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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RAB23Q9ULC3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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RAB23Q9ULC3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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RAB23Q9ULC3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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RAB23Q9ULC3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB23Q9ULC3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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