Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms