Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC24A2Q9UI40 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC24A2Q9UI40 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms