Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF20Q9UGU0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms