Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PEF1Q9UBV8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms