Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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