Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms